มหาวิทยาลัย Purdue สร้าง framework lemons ช่วยเก็บ PDB

สร้าง framework lemons หนึ่งในความท้าทายอย่างหนึ่งคือการใช้ machine learning เพื่อผลิตยากระบวนการนี้ใช้คอมพิวเตอร์เพื่อการเก็บข้อมูลที่ต้องการ นักวิทยาศาสตร์จะดึงข้อมูลด้านชีววิทยาและอบรมการใช้งานโปรแกรมระหว่างกลุ่มแพทย์ด้วยกัน เพื่อจำแนกบุคคลเพื่อการให้ยาที่ถูกต้อง

มหาวิทยาลัย Purdue ที่มีนักวิจัยด้านการคิดค้นยารักษาโรค โดยการสร้าง framework ใหม่จากการเก็บข้อมูลใน data mining เพื่อรวบรวมเป็น model ของ machine learning  framework นี้มีชื่อว่า lemon เพื่อช่วยให้นักวิจัยในการเก็บฐานข้อมูลของโปรตีน (PDB) ที่เป็นทรัพยากรที่ซับซ้อนมีโครงสร้างมากกว่า 140,000 ไบโอโมเลกุล และมีการเก็บรวบรวมในทุกสัปดาห์ เริ่มตั้งแต่วันที่ 15 ตุลาคมเป็นต้นมาแล้ว 

PDB เป็นเครื่องมือที่จำเป็นในการเก็บข้อมูลของยา จากการเปิดเผยของเการาฟ โชปร้า ผู้ช่วยนักวิจัยของสถาบันด้านวิทยาศาสตร์ Purdue แห่งหน่วยงานฟิสิกส์เคมีเป็นหัวหน้าทีมในการตั้งชื่อ framework ชื่อใหม่นี้ 

เขากล่าวว่า ปัญหาคือมันต้องใช้เวลาจำนวนมากในการเก็บข้อมูลที่สะสมมาเรื่อยๆ machine learning สามารถช่วยคุณได้ แต่ว่าเราต้องมี framework ที่ดีในการช่วยเหลือคอมพิวเตอร์ในการวิเคราะห์ข้อมูลในส่วนของการเก็บข้อมูลยาที่ปลอดภัยและมีประสิทธิภาพ

แพลตฟอร์ม ซอฟต์แวร์ เลมอนนี้ อยู่ในชุดของ library C++11 ที่พัฒนาขึ้นด้วยภาษา python ในการรวมข้อมูลในฐานข้อมูลโปรตีน (PDB) โดยใช้เวลาไม่กี่นาที มีการโหลดไฟล์มาตรฐาน mmCIF ใน PDB โดยใช้เวลาทั้งหมด 290 นาที แต่ว่าในเฟรมเวิร์กของ lemon จะใช้เวลาเพียง 6 นาทีเท่านั้น เพราะว่ามันทำงานด้วย CPU 8-core

Lemon จะอนุญาตให้ผู้ใช้เขียน function เพิ่มขึ้น จากส่วนเพิ่มเติมของซอฟต์แวร์มาตรฐาน และการพัฒนาฟังก์ชันขึ้นมาใหม่ ที่ไม่ซ้ำกัน 

โจนาธาน ไฟน์ กล่าวว่านักศึกษาด้านฟิสิกส์เคมีกล่าวว่า โครงสร้างจากการทดลองนี้ถูกเก็บใน PDB ทำให้เกิดความก้าวหน้าทางด้านการศึกษาทางชีววิทยา,การแพทย์ และศาสตร์อื่นๆ ที่เกี่ยวข้อง เราสร้าง framework lemon เหมือนเป็นร้านค้าครบวงจรในการเก็บข้อมูลเข้าไป และสามารถดึงข้อมูลด้านชีววิทยา และสิ่งนี้เป็นปัจจัยสำคัญที่ช่วยการผลิตยาได้ดียิ่งขึ้น

Lemon เป็นชื่อตั้งขึ้นสำหรับเก็บชุดของโปรแกรมพัฒนาเรื่องยารักษาโรคและ หมายความว่า Lemons ไม่ใช่เพียงแค่โมเดลทั่วไปแต่มันทำงานร่วมกับโมเลกุลอื่นๆ ได้เป็นอย่างดี

นักฟิกส์เคมีพยายามพัฒนาโปรแกรมเพื่อเก็บฐานข้อมูลของโปรตีน เพื่อนำมาสังเคราะห์เป็นยารักษาโรคในการช่วยเหลือผู้ป่วย ในส่วนของเอกสารหรือข้อมูลอื่นๆ เพิ่มเติมสามารถเข้าไปดูรายละเอียดได้ที่ https://chopralab.github.io/lemon/latest/index.html หรือดาวน์โหลดซอร์สโค้ดเพื่อศึกษาได้ที่ https://github.com/chopralab/lemon.

ศาสตร์ทางด้านคอมพิวเตอร์สามารถนำไปประยุกต์ใช้กับทุกวงการ ซึ่งหากว่ามีผู้ใช้งานมันอย่างเหมาะสมมันจะช่วยวงการแพทย์ในการวิเคราะห์หาสาเหตุของโรค การคิดค้นยารักษาโรคได้มากทีเดียว

ซึ่งต้องขอบคุณคริส อดัม แห่งมหาวิทยาลัย Perdue รัฐอินเดียน่า สหรัฐอเมริกา ผู้เขียนที่เปิดเผยเรื่องราวดีๆ เหล่านี้

 

สนับสนุนโดย.  www.ufabet.com เริ่มเดิมพัน

Share on facebook
Facebook
Share on google
Google+
Share on twitter
Twitter
Share on linkedin
LinkedIn
Share on pinterest
Pinterest